تفاوت اصلی بین سئو سایت شرکتی و سئو سایت فروشگاهی در اهداف و رویکردهای آنها نهفته است. سئو سایت شرکتی بیشتر بر ارتقای برند و افزایش آگاهی عمومی تمرکز دارد. در این نوع سئو، محتوای اطلاعاتی و خبری، صفحات خدمات و درباره ما اهمیت زیادی دارند. هدف این است که شرکت‌ها به عنوان منابع معتبر در حوزه خود شناخته شوند و از این طریق اعتماد و اعتبار کسب کنند. استراتژی‌های سئو شرکتی شامل تولید محتواهای با کیفیت، بهینه‌سازی صفحات ثابت، لینک‌سازی خارجی به منابع معتبر و بهینه‌سازی برای کلمات کلیدی مرتبط با خدمات و صنعت شرکت می‌باشد.

در مقابل، سئو سایت فروشگاهی بیشتر بر جذب مشتریان هدفمند و افزایش فروش مستقیم متمرکز است. این نوع سئو شامل بهینه‌سازی صفحات محصول، ایجاد محتوای تعاملی مانند نقد و بررسی محصولات، بهبود تجربه کاربری و سرعت بارگذاری صفحات است. کلمات کلیدی در سئو فروشگاهی معمولاً شامل عبارات تجاری و عباراتی که مشتریان هنگام جستجوی خرید محصول استفاده می‌کنند، هستند. استراتژی‌های سئو فروشگاهی همچنین شامل استفاده از داده‌های ساختاریافته برای نمایش بهتر محصولات در نتایج جستجو، مدیریت نظرات مشتریان و بهینه‌سازی برای تبدیل بازدیدکنندگان به خریداران می‌باشد. در نتیجه، هر دو نوع سئو با اهداف خاص خود، به رویکردهای متفاوتی نیاز دارند تا بهترین نتایج را برای کسب و کارها به ارمغان بیاورند.